Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX7Q7RTT5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSX7Q7RTT5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX7Q7RTT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms