Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTOP1Q7RTM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
OTOP1Q7RTM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OTOP1Q7RTM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP1Q7RTM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.2 ms