Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC80Q76M96 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC80Q76M96 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC80Q76M96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms