Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC55Q6ZSA7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC55Q6ZSA7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC55Q6ZSA7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC55Q6ZSA7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms