Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC73Q6ZRK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC73Q6ZRK6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC73Q6ZRK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms