Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF111Q6ZNA4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF111Q6ZNA4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms