Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCNI2Q6ZMN8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNI2Q6ZMN8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNI2Q6ZMN8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms