Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00575Q6W349 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00575Q6W349 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms