Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SARM1Q6SZW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARM1Q6SZW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SARM1Q6SZW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SARM1Q6SZW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms