Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EMBQ6PCB8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMBQ6PCB8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms