Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLC3Q6P597 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLC3Q6P597 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms