Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF544Q6NX49 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF544Q6NX49 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms