Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTLL5Q6EMB2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL5Q6EMB2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL5Q6EMB2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TTLL5Q6EMB2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL5Q6EMB2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms