Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6AWC8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6AWC8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6AWC8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6AWC8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6AWC8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6AWC8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6AWC8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6AWC8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6AWC8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6AWC8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6AWC8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6AWC8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6AWC8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6AWC8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6AWC8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6AWC8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6AWC8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6AWC8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6AWC8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6AWC8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6AWC8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6AWC8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6AWC8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6AWC8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6AWC8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6AWC8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6AWC8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6AWC8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6AWC8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6AWC8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6AWC8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6AWC8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6AWC8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6AWC8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6AWC8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6AWC8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6AWC8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6AWC8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6AWC8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6AWC8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6AWC8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6AWC8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6AWC8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6AWC8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6AWC8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6AWC8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6AWC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6AWC8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6AWC8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6AWC8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6AWC8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6AWC8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6AWC8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6AWC8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6AWC8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6AWC8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6AWC8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms