Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX4IPQ5VYV7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLX4IPQ5VYV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLX4IPQ5VYV7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX4IPQ5VYV7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms