Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF38BQ5VTL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms