Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFI1BQ5VTD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFI1BQ5VTD9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms