Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM47AQ5JRC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM47AQ5JRC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM47AQ5JRC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM47AQ5JRC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms