Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM61Q5EBN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM61Q5EBN2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM61Q5EBN2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms