Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAL1Q4LDG9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAL1Q4LDG9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms