Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RNF212Q495C1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms