Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFAF6Q330K2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFAF6Q330K2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms