Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MICAQ29983 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICAQ29983 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICAQ29983 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MICAQ29983 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MICAQ29983 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MICAQ29983 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICAQ29983 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICAQ29983 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICAQ29983 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICAQ29983 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICAQ29983 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MICAQ29983 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MICAQ29983 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICAQ29983 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICAQ29983 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MICAQ29983 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICAQ29983 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MICAQ29983 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MICAQ29983 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICAQ29983 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICAQ29983 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICAQ29983 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICAQ29983 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MICAQ29983 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MICAQ29983 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MICAQ29983 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICAQ29983 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICAQ29983 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MICAQ29983 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICAQ29983 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICAQ29983 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MICAQ29983 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICAQ29983 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICAQ29983 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICAQ29983 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MICAQ29983 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MICAQ29983 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICAQ29983 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICAQ29983 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICAQ29983 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MICAQ29983 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICAQ29983 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICAQ29983 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICAQ29983 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICAQ29983 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICAQ29983 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICAQ29983 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MICAQ29983 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICAQ29983 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICAQ29983 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICAQ29983 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICAQ29983 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICAQ29983 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MICAQ29983 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MICAQ29983 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MICAQ29983 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MICAQ29983 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MICAQ29983 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICAQ29983 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICAQ29983 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICAQ29983 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICAQ29983 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICAQ29983 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICAQ29983 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MICAQ29983 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MICAQ29983 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MICAQ29983 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MICAQ29983 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MICAQ29983 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICAQ29983 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MICAQ29983 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICAQ29983 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICAQ29983 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MICAQ29983 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICAQ29983 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MICAQ29983 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICAQ29983 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICAQ29983 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICAQ29983 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICAQ29983 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MICAQ29983 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MICAQ29983 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MICAQ29983 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms