Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIDA1Q1XH10 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SKIDA1Q1XH10 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIDA1Q1XH10 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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