Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SURF1Q15526 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SURF1Q15526 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SURF1Q15526 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SURF1Q15526 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
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