Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R7Q15435 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R7Q15435 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R7Q15435 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R7Q15435 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R7Q15435 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R7Q15435 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R7Q15435 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms