Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME4Q14997 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME4Q14997 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME4Q14997 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME4Q14997 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSME4Q14997 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSME4Q14997 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms