Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39AQ14964 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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RAB39AQ14964 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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RAB39AQ14964 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39AQ14964 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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