Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKP1Q13835 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKP1Q13835 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKP1Q13835 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms