Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPA4Q13156 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPA4Q13156 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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