Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 LCP5YER127W 1074 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 HGH1YGR187C 1185 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YKL077WYKL077W 1179 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 SWD1YAR003W 1281 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 ARA2YMR041C 1008 nt6.61□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 RQC1YDR333C 2172 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 STT3YGL022W 2157 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 FAF1YIL019W 1041 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YLR122CYLR122C 378 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 TMA46YOR091W 1038 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YBR113WYBR113W 483 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 FMP40YPL222W 2067 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 CRH1YGR189C 1524 nt6.6□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 COQ1YBR003W 1422 nt6.59□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YIL108WYIL108W 2091 nt6.59□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 PEX31YGR004W 1389 nt6.59□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 HOC1YJR075W 1191 nt6.59□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.59□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 SNU71YGR013W 1863 nt6.59□□□□□ -1.35
UBX3Q12229 YNL040WYNL040W 1371 nt6.58□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 FCY22YER060W-A 1593 nt6.58□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 YNL017CYNL017C 339 nt6.58□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 NMD5YJR132W 3147 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 COG1YGL223C 1254 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 LIA1YJR070C 978 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 DFR1YOR236W 636 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 ATP4YPL078C 735 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 RPL5YPL131W 894 nt6.57□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 PPM2YOL141W 2088 nt6.56□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 POX1YGL205W 2247 nt6.56□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 YPL277CYPL277C 1464 nt6.56□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 DYS1YHR068W 1164 nt6.56□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 LSC1YOR142W 990 nt6.56□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 MRPL23YOR150W 492 nt6.56□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 HIS1YER055C 894 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 RMA1YKL132C 1293 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 GCN3YKR026C 918 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 DID2YKR035W-A 615 nt6.55□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 YOR389WYOR389W 1875 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 HEM2YGL040C 1029 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 RRP46YGR095C 672 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 OPI8YKR035C 642 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 YNL092WYNL092W 1203 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 TOS6YNL300W 309 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 OPI11YPR044C 354 nt6.54□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 YKL102CYKL102C 306 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 YTH1YPR107C 627 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 CYS4YGR155W 1524 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 YCR061WYCR061W 1896 nt6.53□□□□□ -1.36
UBX3Q12229 FMO1YHR176W 1299 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 ASF1YJL115W 840 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 RNH1YMR234W 1047 nt6.52□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 HEM1YDR232W 1647 nt6.51□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 LCL3YGL085W 825 nt6.51□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 MIA40YKL195W 1212 nt6.51□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 GDA1YEL042W 1557 nt6.51□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 COX10YPL172C 1389 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 GPD1YDL022W 1176 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 YDR415CYDR415C 1125 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 ATG36YJL185C 882 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 YJR107WYJR107W 987 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 RFC4YOL094C 972 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 SMK1YPR054W 1167 nt6.5□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 HXT13YEL069C 1695 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 MSB3YNL293W 1902 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 YPT1YFL038C 621 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 YPR204WYPR204W 3099 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 EDE1YBL047C 4146 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 NSE5YML023C 1671 nt6.49□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 MRPL35YDR322W 1104 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 TOM20YGR082W 552 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 YKR032WYKR032W 315 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 MEU1YLR017W 1014 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 ADH5YBR145W 1056 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 ADE17YMR120C 1779 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 CDC13YDL220C 2775 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 BDF2YDL070W 1917 nt6.48□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 BUD9YGR041W 1644 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 YHK8YHR048W 1545 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 HSP12YFL014W 330 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 YRB2YIL063C 984 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 ECM38YLR299W 1983 nt6.47□□□□□ -1.37
UBX3Q12229 SAL1YNL083W 1485 nt6.47□□□□□ -1.37
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