Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 MRPL35YDR322W 1104 nt7.93□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 PIC2YER053C 903 nt7.93□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 PTC7YHR076W 1032 nt7.93□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 REC107YJR021C 945 nt7.93□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YLL058WYLL058W 1728 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YCR041WYCR041W 333 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 MMS21YEL019C 804 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YGL118CYGL118C 438 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 ATP10YLR393W 840 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 MSG5YNL053W 1470 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 TOD6YBL054W 1578 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 NDE1YMR145C 1683 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 PAP1YKR002W 1707 nt7.92□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YER137CYER137C 447 nt7.91□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 YNR068CYNR068C 819 nt7.91□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 NUP49YGL172W 1419 nt7.91□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 ICP55YER078C 1536 nt7.91□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 TDP1YBR223C 1635 nt7.91□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 VBA5YKR105C 1749 nt7.91□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 NMD5YJR132W 3147 nt7.91□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 IES1YFL013C 2079 nt7.9□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 GAT1YFL021W 1533 nt7.9□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 ERR1YOR393W 1314 nt7.9□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 ERR2YPL281C 1314 nt7.9□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 SNF4YGL115W 969 nt7.9□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 SMX3YPR182W 261 nt7.9□□□□□ -1.14
SSF2Q12153 FMP40YPL222W 2067 nt7.9□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 EAF5YEL018W 840 nt7.89□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 MSC3YLR219W 2187 nt7.88□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 PRI1YIR008C 1230 nt7.88□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 SPG5YMR191W 1122 nt7.88□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 SPS22YCL048W 1392 nt7.87□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 SEM1YDR363W-A 270 nt7.87□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 HGH1YGR187C 1185 nt7.87□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 YLR112WYLR112W 420 nt7.87□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 MRPL24YMR193W 777 nt7.87□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 YMR253CYMR253C 1245 nt7.87□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 GPA1YHR005C 1419 nt7.86□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 MRPS28YDR337W 861 nt7.86□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 RPL2BYIL018W 765 nt7.86□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 AIM2YAL049C 741 nt7.86□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 RPL31BYLR406C 342 nt7.86□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 ATP4YPL078C 735 nt7.86□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 PRP40YKL012W 1752 nt7.86□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 SNT309YPR101W 528 nt7.85□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 MET30YIL046W 1923 nt7.85□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 DIT1YDR403W 1611 nt7.85□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 CRH1YGR189C 1524 nt7.84□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.84□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 YNL190WYNL190W 615 nt7.84□□□□□ -1.15
SSF2Q12153 MSS116YDR194C 1995 nt7.83□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 LCL3YGL085W 825 nt7.83□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 CLB4YLR210W 1383 nt7.83□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 POB3YML069W 1659 nt7.83□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 LAG2YOL025W 1983 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 CEM1YER061C 1329 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 YMR034CYMR034C 1305 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 TUF1YOR187W 1314 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 BMT5YIL096C 1011 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 RSA3YLR221C 663 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 FCP1YMR277W 2199 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 YNL194CYNL194C 906 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 YBR138CYBR138C 1575 nt7.82□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 YCR061WYCR061W 1896 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 CNM67YNL225C 1746 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 ASF1YJL115W 840 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 SRY1YKL218C 981 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 YOL079WYOL079W 399 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 AIM41YOR215C 558 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 DSE3YOR264W 1293 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 AMN1YBR158W 1650 nt7.81□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 HED1YDR014W-A 489 nt7.8□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 MRPL28YDR462W 444 nt7.8□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 MTR3YGR158C 753 nt7.8□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.8□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 LSC1YOR142W 990 nt7.8□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 SEC62YPL094C 825 nt7.8□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 CMR1YDL156W 1569 nt7.8□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 CBR1YIL043C 855 nt7.79□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 TAF9YMR236W 474 nt7.79□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 YOR012WYOR012W 414 nt7.79□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 ARP10YDR106W 855 nt7.78□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 CBT1YKL208W 816 nt7.78□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 SWD1YAR003W 1281 nt7.78□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 MRPS18YNL306W 654 nt7.78□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 BNA3YJL060W 1335 nt7.78□□□□□ -1.16
SSF2Q12153 BPL1YDL141W 2073 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 NSE5YML023C 1671 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 ATF1YOR377W 1578 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 SAL1YNL083W 1485 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 FMO1YHR176W 1299 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 AIM20YIL158W 615 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 TMA46YOR091W 1038 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 ILV6YCL009C 930 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 PET112YBL080C 1626 nt7.77□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 GUS1YGL245W 2127 nt7.76□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 YFL052WYFL052W 1398 nt7.76□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 YKL102CYKL102C 306 nt7.76□□□□□ -1.17
SSF2Q12153 RFS1YBR052C 633 nt7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 159.8 ms