Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCRN3Q0VDG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCRN3Q0VDG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms