Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDR1Q08345 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDR1Q08345 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
DDR1Q08345 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDR1Q08345 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDR1Q08345 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms