Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.826e-12■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 320.04■□□□□ 0.86e-12■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-12■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.176e-12■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 PRKDC-207ENST00000536483 834 ntTSL 216.16■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 TRIM27-207ENST00000498117 728 ntTSL 317.01■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.927e-8■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.557e-8■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 FSBP-202ENST00000517506 2472 ntTSL 55.38□□□□□ -1.557e-8■■■■■ 38.5
FMR1Q06787 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 38.4
FMR1Q06787 BCL7C-204ENST00000574418 1206 ntTSL 531.86■■■□□ 2.699e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 NCOA5-202ENST00000372291 727 ntTSL 330.99■■■□□ 2.559e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.059e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.999e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.79e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.199e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.899e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.759e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 BCL7C-203ENST00000572628 1603 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.489e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-206ENST00000445745 2570 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.389e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 NUP214-219ENST00000528406 393 ntTSL 317.4■□□□□ 0.389e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.339e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.289e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.169e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 215.6■□□□□ 0.099e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.089e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-217ENST00000617509 627 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.219e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.239e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 SRP9-202ENST00000366838 540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.239e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-205ENST00000437551 2390 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.269e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-207ENST00000451179 1196 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.399e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 NUP214-210ENST00000496921 2977 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.69e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-215ENST00000616073 512 ntTSL 411.22□□□□□ -0.619e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.649e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 CPED1-208ENST00000495036 2198 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.679e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 UBTF-210ENST00000529947 685 ntTSL 39.84□□□□□ -0.839e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.859e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-214ENST00000613966 3231 nt9.36□□□□□ -0.919e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-210ENST00000553869 560 ntTSL 58.82□□□□□ -19e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-212ENST00000556070 567 ntTSL 47.53□□□□□ -1.29e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.259e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 PAX8-AS1-220ENST00000624706 434 ntTSL 54.69□□□□□ -1.669e-11■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 525.83■■□□□ 1.731e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)23.59■■□□□ 1.371e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.911e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.811e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-18■■■■■ 38.1
FMR1Q06787 KDM3A-207ENST00000462197 448 ntTSL 33.03□□□□□ -1.926e-18■■■■■ 37.9
FMR1Q06787 KLF6-203ENST00000461124 764 ntTSL 519.34■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.057e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 UHRF2-206ENST00000469298 990 ntTSL 526.24■■□□□ 1.797e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 PTPN23-202ENST00000456221 592 ntTSL 421.69■■□□□ 1.067e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 PLAA-207ENST00000523212 730 ntTSL 318.82■□□□□ 0.67e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.527e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.437e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 UHRF2-205ENST00000468435 3723 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.417e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 PTPN23-203ENST00000462998 260 ntTSL 313.82□□□□□ -0.27e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 PLAA-201ENST00000397292 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.426e-7■■■■■ 37.7
FMR1Q06787 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 37.6
FMR1Q06787 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 37.6
FMR1Q06787 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 37.6
FMR1Q06787 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 37.4
FMR1Q06787 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 37.3
FMR1Q06787 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 518.63■□□□□ 0.575e-9■■■■■ 37.3
FMR1Q06787 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.515e-9■■■■■ 37.3
FMR1Q06787 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.55e-9■■■■■ 37.3
FMR1Q06787 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 37.3
FMR1Q06787 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.235e-9■■■■■ 37.3
FMR1Q06787 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 37.2
FMR1Q06787 GNL2-206ENST00000488496 539 ntTSL 218.93■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 37.2
FMR1Q06787 IP6K2-227ENST00000479914 1077 ntTSL 1 (best)20.95■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 IP6K2-220ENST00000449563 580 ntTSL 416.7■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 IP6K2-206ENST00000413654 553 ntTSL 415.7■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 IP6K2-224ENST00000454335 631 ntTSL 414.3□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 IP6K2-204ENST00000412850 543 ntTSL 413.59□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 IP6K2-215ENST00000437427 576 ntTSL 412.71□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 IP6K2-217ENST00000443853 579 ntTSL 312.71□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 22e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.972e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 NOCT-203ENST00000630479 1572 ntTSL 526.84■■□□□ 1.892e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.812e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 WDR33-203ENST00000408998 583 ntTSL 424.63■■□□□ 1.532e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 HPS3-206ENST00000486530 1894 ntTSL 523.05■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 HPS3-204ENST00000462030 2486 ntTSL 221.18■□□□□ 0.982e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 ARVCF-208ENST00000480792 551 ntTSL 320.94■□□□□ 0.942e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.922e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.882e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.662e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 518.12■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 37.1
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 281.2 ms