Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBQ06643 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBQ06643 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBQ06643 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBQ06643 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBQ06643 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBQ06643 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBQ06643 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBQ06643 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBQ06643 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBQ06643 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBQ06643 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LTBQ06643 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBQ06643 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBQ06643 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBQ06643 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBQ06643 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBQ06643 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBQ06643 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBQ06643 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBQ06643 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBQ06643 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBQ06643 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBQ06643 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBQ06643 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBQ06643 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBQ06643 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBQ06643 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBQ06643 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBQ06643 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBQ06643 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBQ06643 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBQ06643 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBQ06643 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBQ06643 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBQ06643 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBQ06643 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBQ06643 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBQ06643 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBQ06643 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBQ06643 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBQ06643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBQ06643 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBQ06643 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBQ06643 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBQ06643 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBQ06643 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBQ06643 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBQ06643 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBQ06643 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBQ06643 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBQ06643 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBQ06643 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBQ06643 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBQ06643 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBQ06643 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBQ06643 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBQ06643 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBQ06643 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBQ06643 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBQ06643 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBQ06643 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBQ06643 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBQ06643 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBQ06643 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBQ06643 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms