Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 DFR1YOR236W 636 nt6.16□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 YPR130CYPR130C 408 nt6.16□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 SKI2YLR398C 3864 nt6.16□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 RIO1YOR119C 1455 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 RPP1YHR062C 882 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 ICS3YJL077C 396 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 TMA46YOR091W 1038 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 YOR343CYOR343C 327 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 SMX3YPR182W 261 nt6.15□□□□□ -1.42
NEJ1Q06148 SQT1YIR012W 1296 nt6.14□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 CRP1YHR146W 1398 nt6.14□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 THI2YBR240C 1353 nt6.14□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 CIA1YDR267C 993 nt6.13□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 ERP2YAL007C 648 nt6.13□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 CIS3YJL158C 684 nt6.13□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 FUS3YBL016W 1062 nt6.13□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 IMA5YJL216C 1746 nt6.13□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 RAP1YNL216W 2484 nt6.13□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 APE4YHR113W 1473 nt6.12□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.12□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 TPO3YPR156C 1869 nt6.12□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 YGL102CYGL102C 429 nt6.11□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 KSH1YNL024C-A 219 nt6.11□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 MOD5YOR274W 1287 nt6.11□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 CCC2YDR270W 3015 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 PET494YNR045W 1470 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 MSY1YPL097W 1479 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 HED1YDR014W-A 489 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 PPM1YDR435C 987 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 HGH1YGR187C 1185 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 PRI1YIR008C 1230 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 BUD20YLR074C 501 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 YLR123CYLR123C 330 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 YLR358CYLR358C 564 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 DUS4YLR405W 1104 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 GEF1YJR040W 2340 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 NTE1YML059C 5040 nt6.1□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 COQ1YBR003W 1422 nt6.09□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 YIL055CYIL055C 1884 nt6.09□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 YML133CYML133C 4125 nt6.09□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 YNL120CYNL120C 486 nt6.09□□□□□ -1.43
NEJ1Q06148 HXT2YMR011W 1626 nt6.08□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 GPI11YDR302W 660 nt6.08□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 DMA1YHR115C 1251 nt6.08□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YLR312CYLR312C 1197 nt6.08□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YPQ1YOL092W 927 nt6.08□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 GYP8YFL027C 1494 nt6.08□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 FET4YMR319C 1659 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 PEX3YDR329C 1326 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 VPS61YDR136C 573 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 HEM2YGL040C 1029 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 SWD1YAR003W 1281 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 MRPL19YNL185C 477 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 RFC4YOL094C 972 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 RKI1YOR095C 777 nt6.07□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 AIM24YJR080C 1185 nt6.06□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YLL056CYLL056C 897 nt6.06□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YML6YML025C 861 nt6.06□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 SEC62YPL094C 825 nt6.06□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 COX10YPL172C 1389 nt6.06□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 SLX5YDL013W 1860 nt6.05□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 COX9YDL067C 180 nt6.05□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.05□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 COQ3YOL096C 939 nt6.05□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YPL067CYPL067C 597 nt6.05□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YCL049CYCL049C 939 nt6.05□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 NMT1YLR195C 1368 nt6.05□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 ICP55YER078C 1536 nt6.04□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 TRR2YHR106W 1029 nt6.04□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YJR146WYJR146W 354 nt6.04□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 PRS4YBL068W 981 nt6.04□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 snR30snR30 606 nt6.04□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 YBR284WYBR284W 2394 nt6.04□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 MRPL1YDR116C 858 nt6.03□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 PDA1YER178W 1263 nt6.03□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 MGM101YJR144W 810 nt6.03□□□□□ -1.44
NEJ1Q06148 MSC3YLR219W 2187 nt6.02□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 PIH1YHR034C 1035 nt6.02□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 PTH2YBL057C 627 nt6.02□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 DOT1YDR440W 1749 nt6.02□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 OGG1YML060W 1131 nt6.01□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 YPL257WYPL257W 582 nt6.01□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 PGM1YKL127W 1713 nt6.01□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 YNL092WYNL092W 1203 nt6□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 BSC4YNL269W 396 nt6□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 YDR514CYDR514C 1452 nt6□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 PFK2YMR205C 2880 nt5.99□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 OAC1YKL120W 975 nt5.99□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 EDC2YER035W 438 nt5.98□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 ICT1YLR099C 1185 nt5.98□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 ARA2YMR041C 1008 nt5.98□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 NUP49YGL172W 1419 nt5.98□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 RGD1YBR260C 2001 nt5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31 ms