Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC63Q05C16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC63Q05C16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC63Q05C16 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC63Q05C16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms