Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 CIR2YOR356W 1896 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 COX5AYNL052W 462 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 DFR1YOR236W 636 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 YBR113WYBR113W 483 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 DOT1YDR440W 1749 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 NUP49YGL172W 1419 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 HEM2YGL040C 1029 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 COG1YGL223C 1254 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 FBA1YKL060C 1080 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 MIA40YKL195W 1212 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 YJL163CYJL163C 1668 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 PHO3YBR092C 1404 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 ARG81YML099C 2643 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 FPR2YDR519W 408 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 SWD1YAR003W 1281 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 AIM33YML087C 939 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 FIT2YOR382W 462 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 CMK2YOL016C 1344 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 EMP65YER140W 1671 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 GLN3YER040W 2193 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 MFG1YDL233W 1377 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 SML1YML058W 315 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 THI2YBR240C 1353 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 FAF1YIL019W 1041 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS38Q05919 UTR2YEL040W 1404 nt7.15□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 AIM46YHR199C 933 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 SQT1YIR012W 1296 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YKR023WYKR023W 1593 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YOX1YML027W 1158 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YNL092WYNL092W 1203 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YNL120CYNL120C 486 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 ATG22YCL038C 1587 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 CCC2YDR270W 3015 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 HDA1YNL021W 2121 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 MSY1YPL097W 1479 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 ERG12YMR208W 1332 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 IDP3YNL009W 1263 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 KSH1YNL024C-A 219 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 RFC4YOL094C 972 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YPR076WYPR076W 375 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 SMC5YOL034W 3282 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 VTS1YOR359W 1572 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 LAT1YNL071W 1449 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 COX10YPL172C 1389 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 AGX1YFL030W 1158 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 RPP1YHR062C 882 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YOL046CYOL046C 675 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 ACO1YLR304C 2337 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YJR146WYJR146W 354 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 DID2YKR035W-A 615 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 RPR1RPR1 369 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 ZIM17YNL310C 525 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 ECM30YLR436C 3825 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 GTT3YEL017W 1014 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YKL077WYKL077W 1179 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YLR123CYLR123C 330 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS38Q05919 YLR312CYLR312C 1197 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 OGG1YML060W 1131 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 PRE5YMR314W 705 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 PPH21YDL134C 1110 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 MRPL23YOR150W 492 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 HEL1YKR017C 1656 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 YUR1YJL139C 1287 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 ASR1YPR093C 867 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 YTH1YPR107C 627 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 CRP1YHR146W 1398 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 YOR268CYOR268C 399 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 YPL257WYPL257W 582 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 AIM24YJR080C 1185 nt7.04□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 KDX1YKL161C 1302 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 DAL7YIR031C 1665 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 YHK8YHR048W 1545 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 KNS1YLL019C 2214 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 UBP13YBL067C 2244 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 YKL102CYKL102C 306 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 PEX13YLR191W 1161 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 PEX3YDR329C 1326 nt7.02□□□□□ -1.28
VPS38Q05919 ISC1YER019W 1434 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 YRB2YIL063C 984 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 ICS3YJL077C 396 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 RNH1YMR234W 1047 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 COQ3YOL096C 939 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 RKI1YOR095C 777 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 COX15YER141W 1461 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 FAL1YDR021W 1200 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 LGE1YPL055C 999 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 MCP1YOR228C 909 nt7□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 YAR064WYAR064W 300 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 FMP40YPL222W 2067 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 MDE1YJR024C 735 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 RMA1YKL132C 1293 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 MOD5YOR274W 1287 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 LDB16YCL005W 771 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 CRH1YGR189C 1524 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 SGV1YPR161C 1974 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS38Q05919 VPS61YDR136C 573 nt6.97□□□□□ -1.29
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