Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YAR064WYAR064W 300 nt8.01□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 MAM3YOL060C 2121 nt8.01□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 SRF1YDL133W 1314 nt8.01□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 PEX31YGR004W 1389 nt8□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 COX10YPL172C 1389 nt8□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 YHK8YHR048W 1545 nt8□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 ATO2YNR002C 849 nt8□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 DFR1YOR236W 636 nt8□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 CCT8YJL008C 1707 nt7.99□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 ATG36YJL185C 882 nt7.99□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 KIN1YDR122W 3195 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 PPH22YDL188C 1134 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 YDR187CYDR187C 519 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 GAL83YER027C 1254 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 DYS1YHR068W 1164 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 COX16YJL003W 357 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 RFC4YOL094C 972 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 OSW2YLR054C 2175 nt7.97□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 PUS7YOR243C 2031 nt7.97□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.97□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 YJR146WYJR146W 354 nt7.97□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 TOS6YNL300W 309 nt7.97□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 YBR027CYBR027C 333 nt7.97□□□□□ -1.13
CSI1Q04368 GGC1YDL198C 903 nt7.96□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 VMA3YEL027W 483 nt7.96□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 HIS1YER055C 894 nt7.96□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 CTF19YPL018W 1110 nt7.96□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 EDE1YBL047C 4146 nt7.96□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 CDC1YDR182W 1476 nt7.95□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 DRE2YKR071C 1047 nt7.95□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YLL066CYLL066C 3618 nt7.95□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 HEM1YDR232W 1647 nt7.95□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 MIA40YKL195W 1212 nt7.94□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YLR184WYLR184W 348 nt7.94□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 MSO1YNR049C 633 nt7.94□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 RPL5YPL131W 894 nt7.94□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 TAE1YBR261C 699 nt7.94□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 POR2YIL114C 846 nt7.93□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 OGG1YML060W 1131 nt7.93□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YPL136WYPL136W 369 nt7.93□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YPL257WYPL257W 582 nt7.93□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 ARE2YNR019W 1929 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 FAL1YDR021W 1200 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 CUP2YGL166W 678 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 GCN3YKR026C 918 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YNL120CYNL120C 486 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YGR054WYGR054W 1929 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YDR415CYDR415C 1125 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YPT1YFL038C 621 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YJR107WYJR107W 987 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 SRL2YLR082C 1179 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 OPI11YPR044C 354 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 SGF29YCL010C 780 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 PPS1YBR276C 2424 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 FRT1YOR324C 1809 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 UIP5YKR044W 1332 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 LYS1YIR034C 1122 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI1Q04368 PTC4YBR125C 1182 nt7.89□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 PTC3YBL056W 1407 nt7.88□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 MPC2YHR162W 390 nt7.88□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 KSH1YNL024C-A 219 nt7.88□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 MSY1YPL097W 1479 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 FBA1YKL060C 1080 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 IMD1YAR073W 1212 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 YLR463CYLR463C 552 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 YMR122CYMR122C 375 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 ADH5YBR145W 1056 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 YMR279CYMR279C 1623 nt7.86□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 YML018CYML018C 1182 nt7.86□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 GTO3YMR251W 1101 nt7.86□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 ZWF1YNL241C 1518 nt7.86□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 MSP1YGR028W 1089 nt7.85□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 TDH2YJR009C 999 nt7.85□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 MDE1YJR024C 735 nt7.85□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 RRP9YPR137W 1722 nt7.85□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 SQT1YIR012W 1296 nt7.84□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 RUF23RUF23 254 nt7.84□□□□□ -1.15
CSI1Q04368 THI2YBR240C 1353 nt7.84□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 YLR173WYLR173W 1827 nt7.83□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 YKR032WYKR032W 315 nt7.83□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 NSG2YNL156C 900 nt7.83□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 CCC2YDR270W 3015 nt7.83□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 RQC1YDR333C 2172 nt7.83□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 ECM27YJR106W 2178 nt7.83□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 TFG2YGR005C 1203 nt7.82□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 OPI8YKR035C 642 nt7.82□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 YLR312CYLR312C 1197 nt7.82□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 YPR196WYPR196W 1413 nt7.82□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 LDB16YCL005W 771 nt7.82□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 CTF3YLR381W 2202 nt7.82□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 GLC8YMR311C 690 nt7.81□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 SDH4YDR178W 546 nt7.8□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 PMT3YOR321W 2262 nt7.79□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 YMR295CYMR295C 594 nt7.79□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 Q0010Q0010 387 nt7.79□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 VPS24YKL041W 675 nt7.78□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 ECM31YBR176W 939 nt7.78□□□□□ -1.16
CSI1Q04368 AFG2YLR397C 2343 nt7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.9 ms