Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 URH1YDR400W 1023 nt7.84□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 PRC1YMR297W 1599 nt7.84□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 YDL144CYDL144C 1071 nt7.83□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 YHL018WYHL018W 363 nt7.83□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 YPR196WYPR196W 1413 nt7.83□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 IVY1YDR229W 1362 nt7.83□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 CHA1YCL064C 1083 nt7.82□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 ATP10YLR393W 840 nt7.82□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 COQ1YBR003W 1422 nt7.82□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 CTF19YPL018W 1110 nt7.82□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 SGF29YCL010C 780 nt7.81□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 COX10YPL172C 1389 nt7.81□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 ERG1YGR175C 1491 nt7.81□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 PPM2YOL141W 2088 nt7.8□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 VPS24YKL041W 675 nt7.8□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 YPL041CYPL041C 624 nt7.8□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 YPL264CYPL264C 1062 nt7.8□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 FCY2YER056C 1602 nt7.8□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 TDP1YBR223C 1635 nt7.8□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 EMP65YER140W 1671 nt7.79□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 UBP13YBL067C 2244 nt7.79□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 YHR020WYHR020W 2067 nt7.79□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 TIM22YDL217C 624 nt7.79□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 FLC2YAL053W 2352 nt7.79□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 PTC3YBL056W 1407 nt7.78□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 SEN34YAR008W 828 nt7.78□□□□□ -1.16
SYF1Q04048 CAN1YEL063C 1773 nt7.77□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 GPA2YER020W 1350 nt7.77□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 YDL177CYDL177C 513 nt7.77□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 PSR2YLR019W 1194 nt7.77□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 MSO1YNR049C 633 nt7.77□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 ATG36YJL185C 882 nt7.76□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 ATO2YNR002C 849 nt7.76□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 HXT9YJL219W 1704 nt7.75□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 YSC83YHR017W 1158 nt7.75□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 TUF1YOR187W 1314 nt7.75□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 SIT4YDL047W 936 nt7.74□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 LYS1YIR034C 1122 nt7.74□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 YKR023WYKR023W 1593 nt7.73□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 STF1YDL130W-A 261 nt7.73□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 TRS31YDR472W 852 nt7.73□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 SRL2YLR082C 1179 nt7.73□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 RFC4YOL094C 972 nt7.73□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 RVB2YPL235W 1416 nt7.72□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 TSR3YOR006C 942 nt7.72□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 CDC13YDL220C 2775 nt7.72□□□□□ -1.17
SYF1Q04048 SNN1YNL086W 309 nt7.71□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 RUF23RUF23 254 nt7.71□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 YPL102CYPL102C 303 nt7.71□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 HDA1YNL021W 2121 nt7.7□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.7□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 ENV7YPL236C 1095 nt7.7□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 MSB3YNL293W 1902 nt7.7□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 HXT13YEL069C 1695 nt7.7□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 FAL1YDR021W 1200 nt7.69□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 SDH4YDR178W 546 nt7.69□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 EGD2YHR193C 525 nt7.69□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 DOT5YIL010W 648 nt7.69□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 AAT2YLR027C 1257 nt7.69□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 GLC8YMR311C 690 nt7.69□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 YDL172CYDL172C 480 nt7.68□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 SYF2YGR129W 648 nt7.68□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 YMR253CYMR253C 1245 nt7.68□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 PTC4YBR125C 1182 nt7.68□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 CEM1YER061C 1329 nt7.68□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 ARE2YNR019W 1929 nt7.68□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 YJR146WYJR146W 354 nt7.67□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 DID2YKR035W-A 615 nt7.67□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 LOT6YLR011W 576 nt7.67□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 SPE4YLR146C 903 nt7.67□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 RMD8YFR048W 1989 nt7.67□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 PRY3YJL078C 2646 nt7.66□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 GTO3YMR251W 1101 nt7.66□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 YNL040WYNL040W 1371 nt7.66□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 RAD59YDL059C 717 nt7.65□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 PAC2YER007W 1557 nt7.65□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 ERP5YHR110W 639 nt7.65□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 ECM19YLR390W 339 nt7.65□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 SUR7YML052W 909 nt7.65□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 CSL4YNL232W 879 nt7.65□□□□□ -1.18
SYF1Q04048 STT3YGL022W 2157 nt7.64□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 MRPL28YDR462W 444 nt7.64□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 BUD32YGR262C 786 nt7.64□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 OGG1YML060W 1131 nt7.64□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YPL257WYPL257W 582 nt7.64□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YDL218WYDL218W 954 nt7.63□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YJR084WYJR084W 1272 nt7.63□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 SNT309YPR101W 528 nt7.63□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 ENB1YOL158C 1821 nt7.63□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 AQR1YNL065W 1761 nt7.63□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 CRF1YDR223W 1404 nt7.62□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 IRC11YOR013W 471 nt7.62□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 AMN1YBR158W 1650 nt7.62□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 SGV1YPR161C 1974 nt7.61□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 OPI11YPR044C 354 nt7.61□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YLL066CYLL066C 3618 nt7.6□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YLL067CYLL067C 3618 nt7.6□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YGR054WYGR054W 1929 nt7.6□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YCR041WYCR041W 333 nt7.6□□□□□ -1.19
SYF1Q04048 YDR015CYDR015C 240 nt7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.2 ms