Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 REG2YBR050C 1017 nt7.14□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YPR076WYPR076W 375 nt7.14□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YPR127WYPR127W 1038 nt7.14□□□□□ -1.27
SND1Q04007 CNM67YNL225C 1746 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 PET112YBL080C 1626 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 MKK1YOR231W 1527 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YMR027WYMR027W 1413 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 SNF4YGL115W 969 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YLR112WYLR112W 420 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 NTG2YOL043C 1143 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YOL046CYOL046C 675 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 SEC23YPR181C 2307 nt7.13□□□□□ -1.27
SND1Q04007 MSN2YMR037C 2115 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YCR041WYCR041W 333 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YAL045CYAL045C 309 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 IRC11YOR013W 471 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 FIT2YOR382W 462 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 ECM2YBR065C 1095 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 PPS1YBR276C 2424 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 EFM1YHL039W 1758 nt7.12□□□□□ -1.27
SND1Q04007 BIO3YNR058W 1443 nt7.11□□□□□ -1.27
SND1Q04007 HHY1YEL059W 309 nt7.11□□□□□ -1.27
SND1Q04007 GUS1YGL245W 2127 nt7.11□□□□□ -1.27
SND1Q04007 CTA1YDR256C 1548 nt7.11□□□□□ -1.27
SND1Q04007 MPH3YJR160C 1809 nt7.11□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YIL108WYIL108W 2091 nt7.1□□□□□ -1.27
SND1Q04007 SLA2YNL243W 2907 nt7.1□□□□□ -1.27
SND1Q04007 HPT1YDR399W 666 nt7.1□□□□□ -1.27
SND1Q04007 LDB7YBL006C 543 nt7.1□□□□□ -1.27
SND1Q04007 TAF11YML015C 1041 nt7.1□□□□□ -1.27
SND1Q04007 CDS1YBR029C 1374 nt7.09□□□□□ -1.27
SND1Q04007 PAC10YGR078C 600 nt7.09□□□□□ -1.27
SND1Q04007 JJJ3YJR097W 519 nt7.09□□□□□ -1.27
SND1Q04007 TFB4YPR056W 1017 nt7.09□□□□□ -1.27
SND1Q04007 COX15YER141W 1461 nt7.09□□□□□ -1.27
SND1Q04007 DAL4YIR028W 1908 nt7.09□□□□□ -1.27
SND1Q04007 YNL247WYNL247W 2304 nt7.09□□□□□ -1.28
SND1Q04007 DLD1YDL174C 1764 nt7.08□□□□□ -1.28
SND1Q04007 AGX1YFL030W 1158 nt7.08□□□□□ -1.28
SND1Q04007 SIR2YDL042C 1689 nt7.08□□□□□ -1.28
SND1Q04007 PPH21YDL134C 1110 nt7.07□□□□□ -1.28
SND1Q04007 EAF5YEL018W 840 nt7.07□□□□□ -1.28
SND1Q04007 MIX17YMR002W 471 nt7.07□□□□□ -1.28
SND1Q04007 TDP1YBR223C 1635 nt7.07□□□□□ -1.28
SND1Q04007 AIM17YHL021C 1398 nt7.07□□□□□ -1.28
SND1Q04007 IRC5YFR038W 2562 nt7.07□□□□□ -1.28
SND1Q04007 CYS4YGR155W 1524 nt7.06□□□□□ -1.28
SND1Q04007 HOC1YJR075W 1191 nt7.06□□□□□ -1.28
SND1Q04007 HMS2YJR147W 1077 nt7.06□□□□□ -1.28
SND1Q04007 SCO2YBR024W 906 nt7.06□□□□□ -1.28
SND1Q04007 KNS1YLL019C 2214 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 SRF1YDL133W 1314 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 YGL102CYGL102C 429 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 PTC7YHR076W 1032 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 LIA1YJR070C 978 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 YBL070CYBL070C 321 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 HOS2YGL194C 1359 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 CCT3YJL014W 1605 nt7.05□□□□□ -1.28
SND1Q04007 GYP8YFL027C 1494 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 MSG5YNL053W 1470 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 AIM2YAL049C 741 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 YLL056CYLL056C 897 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 MRPL19YNL185C 477 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 YOR111WYOR111W 699 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 ASR1YPR093C 867 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 KIN1YDR122W 3195 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 GSH1YJL101C 2037 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 PMT3YOR321W 2262 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 ATG7YHR171W 1893 nt7.04□□□□□ -1.28
SND1Q04007 CDC13YDL220C 2775 nt7.03□□□□□ -1.28
SND1Q04007 MIP1YOR330C 3765 nt7.03□□□□□ -1.28
SND1Q04007 REC107YJR021C 945 nt7.03□□□□□ -1.28
SND1Q04007 VBA5YKR105C 1749 nt7.03□□□□□ -1.28
SND1Q04007 GPD1YDL022W 1176 nt7.02□□□□□ -1.29
SND1Q04007 CBT1YKL208W 816 nt7.02□□□□□ -1.29
SND1Q04007 YNL194CYNL194C 906 nt7.02□□□□□ -1.29
SND1Q04007 SNT309YPR101W 528 nt7.02□□□□□ -1.29
SND1Q04007 FCY22YER060W-A 1593 nt7.02□□□□□ -1.29
SND1Q04007 PRP40YKL012W 1752 nt7.02□□□□□ -1.29
SND1Q04007 CEM1YER061C 1329 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 NUP49YGL172W 1419 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 HSM3YBR272C 1443 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 YLL058WYLL058W 1728 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 SSC1YJR045C 1965 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 OCA1YNL099C 717 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 ICP55YER078C 1536 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 FCP1YMR277W 2199 nt7.01□□□□□ -1.29
SND1Q04007 TOS2YGR221C 1869 nt7□□□□□ -1.29
SND1Q04007 BSC5YNR069C 1470 nt7□□□□□ -1.29
SND1Q04007 HMT1YBR034C 1047 nt7□□□□□ -1.29
SND1Q04007 SMX3YPR182W 261 nt7□□□□□ -1.29
SND1Q04007 ATG18YFR021W 1503 nt7□□□□□ -1.29
SND1Q04007 MCH2YKL221W 1422 nt7□□□□□ -1.29
SND1Q04007 AMN1YBR158W 1650 nt7□□□□□ -1.29
SND1Q04007 PRI1YIR008C 1230 nt6.99□□□□□ -1.29
SND1Q04007 YJU2YKL095W 837 nt6.99□□□□□ -1.29
SND1Q04007 YMR147WYMR147W 672 nt6.99□□□□□ -1.29
SND1Q04007 SPG5YMR191W 1122 nt6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 76.6 ms