Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB1Q02641 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CACNB1Q02641 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms