Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NHLH2Q02577 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NHLH2Q02577 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms