Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PAX5Q02548 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAX5Q02548 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms