Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPEQ02224 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPEQ02224 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPEQ02224 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms