Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PLCB3Q01970 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PLCB3Q01970 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLCB3Q01970 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms