Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC5Q00444 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC5Q00444 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms