Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA4AP68366 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA4AP68366 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBA4AP68366 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA4AP68366 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms