Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTBP60709 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTBP60709 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTBP60709 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTBP60709 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTBP60709 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTBP60709 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTBP60709 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTBP60709 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTBP60709 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTBP60709 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTBP60709 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTBP60709 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTBP60709 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTBP60709 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTBP60709 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTBP60709 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTBP60709 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTBP60709 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTBP60709 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTBP60709 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTBP60709 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTBP60709 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTBP60709 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTBP60709 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTBP60709 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTBP60709 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTBP60709 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTBP60709 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTBP60709 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTBP60709 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTBP60709 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTBP60709 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTBP60709 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTBP60709 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTBP60709 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTBP60709 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTBP60709 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBP60709 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBP60709 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBP60709 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBP60709 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBP60709 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBP60709 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBP60709 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBP60709 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBP60709 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBP60709 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBP60709 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBP60709 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms